بررسی ساختار و خواص نانوسوئیچ های زیستی ampb-peptides با استفاده از روش های ab initio
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علم و صنعت ایران - دانشکده شیمی
- نویسنده سمانه باقری نویر
- استاد راهنما محمدعلی صفرپور مریم جمالی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1387
چکیده
فعالیت یک سیستم بیولوژیکی، مثل یک آنزیم، میتواند به وسیله اتصال یک سوئیچ نوری به ساختارش کنترل شود. در سیستمهای بیولوژیکی، ایزومریزاسیون برگشت پذیر به¬وسیل? نور یک مولکول متصل به سیستم بزرگ مولکول، موجب تغییرات ساختاری مولکول می¬شود که منجر به پاسخ فیزیولوژیکی پروتئین می¬شود. آزوبنزن یک سوئیچ مناسب برای تغییرات سریع ساختاری می¬باشد. تغییرات ساختاری پپتیدهای حلقوی آزوبنزن، شامل سوئیچ های نوری (4-آمینو متیل) فنیل آزوبنزوئیک اسید (ampb) و (4-آمینو) فنیل آزوبنزوئیک اسید (apb) و قسمت های پپتیدی متشکل از 8 آمینواسید، با استفاده از روش های کوانتوم مکانیکی مورد مطالعه و بررسی قرار گرفتند. خواصی نظیر ساختار و شکل هندسی، انرژی، ممان-دوقطبی، قطبش پذیری، hlg و ?max در دو حالت سیس و ترانس این پپتیدها با استفاده از روش های کوانتوم مکانیکی محاسبه شده و مورد مقایسه و بررسی قرار گرفته¬اند.
منابع مشابه
بررسی انرژی و تفاوت های ساختاری پیگمنتهای چندعامله دی آزو با استفاده از روش ab initio
ترکیبات آزو آروماتیک به طور گسترده به عنوان رنگینه ها و پیگمانتها در انواع محصولات سنتزی صنعتی و شیمیایی استفاده می شوند. همچنین آنها در موارد مفید دیگری همچون واکنش های زیستی، تکنولوژی ذخیره نوری و اثرات الکترونیکی نور نیز نقش مهمی را ایفا می کنند. محاسبات تئوری لحاظ شده برای تعیین خواص و ویژگی های ساختاری ترکیبات آزو، کاملا با روش های تجربی قابل رقابت است. محاسباتab initio یک تصویری از پیکربن...
15 صفحه اولJust How Ab Initio Is Ab Initio Quantum Chemistry?
Quantum Mechanics has been the most spectacularly successful theory in the history of science. As is often mentioned the accuracy to which the gyromagnetic ratio of the electron can be calculated is a staggering nine decimal places. Quantum Mechanics has revolutionized the study of radiation and matter since its inception just over one hundred years ago. The impact of the theory has been felt i...
متن کاملمطالعه بر همکنش مولکول so2 با نانولوله های کربنی خالص و آلاییده شده با استفاده از روش های ab initio
هدف از این تحقیق مطالعه بر همکنش مولکول so2 با نانولوله های کربنی تک دیواره خالص و آلاییده شده با اتم های بور و نیتروژن بااستفاده از روش های ab initio می باشد.نتایج به دست آمده حاکی از این است که بر همکنش نانولوله های آلاییده شده با بور ، با مولکول های so2 بزرگتر از برهمکنش نانولوله های کربنی خالص و n-آلاییده شده با so2 می باشد.لذا این ترکیبات می توانند به عنوان پایه ای برای حسگر های مناسب so2...
15 صفحه اولAb-Initio Molecular Dynamics
Computer simulation methods, such as Monte Carlo or Molecular Dynamics, are very powerful computational techniques that provide detailed and essentially exact information on classical many-body problems. With the advent of ab-initio molecular dynamics, where the forces are computed on-the-fly by accurate electronic structure calculations, the scope of either method has been greatly extended. Th...
متن کاملروش جدیدی در سنتز زانتن ها و مطالعه ساختار فراورده ها با محاسبات ab-initio
مشتقات زانتن ها و دی بنزو زانتن ها به علت دارا بودن خواص بیولوژیکی متنوع و خواص دارویی از قبیل ضد ویروس، ضد باکتری و ضد التهاب مورد توجه بسیاری از شیمی دان ها قرار گرفته اند. در سال های اخیر مطالعه های زیادی روی سنتز مشتقات جدید و هم چنین ارائه روش های جدید سنتز آنها انجام گرفته است. در این تحقیق، روش جدیدی برای سنتز برخی مشتقات زانتن و دی بنزو زانتن در مجاورت نانو کاتالیزگر fe3o4 و با تابش ا...
15 صفحه اولAb initio Ehrenfest dynamics.
We present an ab initio direct Ehrenfest dynamics scheme using a three time-step integrator. The three different time steps are implemented with nuclear velocity Verlet, nuclear-position-coupled midpoint Fock integrator, and time-dependent Hartree-Fock with a modified midpoint and unitary transformation algorithm. The computational cost of the ab initio direct Ehrenfest dynamics presented here ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علم و صنعت ایران - دانشکده شیمی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023